Alla vigilia dello scoppio della seconda guerra mondiale, il sentimento anticoloniale ribolliva nel sud-est asiatico. Durante la guerra, l'esercito imperiale giapponese ha attraversato la regione con grande rapidità. Mentre alcuni locali potevano essere inizialmente ottimisti riguardo alla cacciata degli imperialisti europei, i giapponesi si dimostrarono dei governanti brutali; milioni di persone furono arruolate per lavori forzati. Nel tentativo di ottenere la cooperazione locale, i giapponesi alimentarono le fiamme del risentimento verso l'Occidente; come conseguenza involontaria, alla fine della guerra, quando i giapponesi si ritirarono e gli europei tornarono, il sentimento nazionalista era non solo alto ma anche organizzato.
Una dopo l'altra, le ex colonie hanno vinto o ottenuto l'indipendenza, solo per affrontare nuove sfide: rivoltosi civili, insorti delle minoranze e guerriglieri comunisti - spesso agendo su istigazione delle potenze della guerra fredda, Cina, Unione Sovietica e Stati Uniti - hanno spesso minato la stabilità.
Il Vietnam, dopo la liberazione dai francesi, fu inizialmente diviso in due, con il nord che andava al leader della resistenza e marxista Ho Chi Minh e il sud all'anticomunista Ngo Dinh Diem. Gli Stati Uniti temevano un Vietnam comunista e intervennero - prima surrettiziamente e poi con una guerra totale - per ostacolare gli sforzi del Nord di unire il paese sotto il dominio comunista. Il Nord vinse, ma solo dopo perdite catastrofiche da entrambe le parti.
Nel frattempo una guerra ombra si stava svolgendo in Cambogia e Laos, mentre i bombardieri americani cercavano di sradicare i guerriglieri comunisti vietnamiti usando il passaggio attraverso i vicini del Vietnam. La Cambogia si dissolse nella guerra civile e i Khmer Rossi presero il potere. Il nuovo regime, sotto Pol Pot, aspirava a una società comunista agraria etnicamente khmer. Un gran numero della popolazione - circa 1,5 milioni di cambogiani (20% della popolazione) - furono uccisi in purghe prima che le forze vietnamite mettessero fine al crudele e terrificante regno dei Khmer Rossi nel 1979.
Le purghe anticomuniste in Indonesia negli anni '60 hanno provocato centinaia di migliaia di morti e la dittatura di Suharto, durata tre decenni. Un colpo di stato del 1962 ha inaugurato un mezzo secolo di governo militare quasi ininterrotto in Myanmar. La Thailandia ha avuto una dozzina di colpi di stato militari dal 1932. La Malesia e specialmente Singapore sono salutate come le storie di successo del dopoguerra nella regione, anche se l'ordine è stato spesso mantenuto a spese delle libertà civili, attraverso leggi anti-sedizione e restrizioni alla libertà di stampa.