Richard Henderson CH FRS FMedSci (nato il 19 luglio 1945) è un biologo molecolare e biofisico scozzese. È un pioniere nel campo della microscopia elettronica delle molecole biologiche. Ha condiviso il Premio Nobel per la Chimica nel 2017 con Jacques Dubochet e Joachim Frank.

Henderson ha lavorato presso il Medical Research Council Laboratory of Molecular Biology (MRC LMB) di Cambridge dal 1973, ed è stato il suo direttore tra il 1996 e il 2006. È stato anche visiting professor presso il Miller Institute dell'Università della California, Berkeley, nella primavera del 1993.

Ha elaborato la struttura della batteriorhodopsina, una molecola batterica. La molecola cattura l'energia dalla luce e la usa per spostare i protoni fuori dalla cellula. Questo è stato il secondo modello atomico di una proteina di membrana. Le tecniche sviluppate da Henderson per la cristallografia elettronica sono ancora in uso.

I metodi di Henderson aiutano a risolvere le strutture di diversi recettori accoppiati alla proteina G (GPCR). Si tratta di una grande famiglia di recettori proteici che rilevano le molecole al di fuori della cellula. Essi attivano i percorsi interni di trasduzione del segnale. Questo porta a risposte cellulari alle molecole al di fuori della cellula.