Yuji Naka (中 裕司, Naka Yūji, nato il 17 settembre 1965) è un programmatore, designer e produttore di videogiochi giapponese. È meglio conosciuto come l'ex capo del Sonic Team, dove è stato il programmatore principale della serie originale di giochi Sonic the Hedgehog sul Sega Genesis. Nel 2006, ha creato Prope, una società di giochi indipendente. Nel gennaio 2018, si è unito a Square Enix.
Naka ha imparato a programmare copiando e debuggando il codice dei videogiochi stampato nelle riviste. L'esperienza gli fece venire voglia di studiare gli assemblatori e di esercitarsi a scrivere codice durante le lezioni scolastiche. Dopo il diploma di scuola superiore, Naka ha deciso di saltare l'università e di rimanere nella sua città natale.
Intorno al 1983, Naka vide che Sega stava cercando degli assistenti di programmazione. Decise di fare domanda. Dopo un breve colloquio, iniziò a lavorare per Sega nell'aprile 1984. Il suo primo compito fu la progettazione di mappe e il controllo dei floppy disk per un gioco chiamato Road Runner per l'SF-7000. Naka non ricorda se il gioco fu mai rilasciato. Il suo primo grande progetto fu un gioco chiamato Girl's Garden. Lui e Hiroshi Kawaguchi lo crearono insieme come parte del loro processo di formazione.
| Anno | Gioco | Ruolo |
| 1984 | Giardino della ragazza | Game designer, programmatore |
| 1986 | Spia contro spia (porta Master System) | Programmatore |
| Cintura nera | ||
| 1987 | Phantasy Star | |
| 1989 | Phantasy Star II | |
| Ghouls 'n Ghosts (porta Genesis) | ||
| 1991 | Sonic the Hedgehog | |
| 1992 | Sonic the Hedgehog 2 | |
| 1994 | Sonic the Hedgehog 3 | Programmatore, produttore |
| Sonic & Knuckles | ||
| 1996 | Notti in sogni | |
| 1998 | Rangers in fiamme | Produttore |
| 1999 | ChuChu Rocket! | Direttore, produttore |
| 2000 | Samba de Amigo | Produttore |
| Phantasy Star Online | ||
| 2001 | Avventura sonico 2 | |
| 2002 | Sonic Advance 2 | Direttore, produttore |
| 2003 | Partito flipper sonico | Produttore |
| Billy Hatcher e l'uovo gigante | ||
| Battaglia sonica | ||
| Eroi sonici | ||
| 2004 | Sonic Advance 3 | |
| Febbre Puyo Pop | ||
| 2005 | Sakura Wars: Addio, amore mio | |
| Ombra il porcospino | ||
| Rush sonico | ||
| Puyo Pop Fever 2 | Produttore generale | |
| 2006 | Cavalieri sonici | Produttore esecutivo |
| Universo Phantasy Star | ||
| 2008 | Battiamo | Produttore |
| 2009 | Ivy il Kiwi? | |
| 2011 | Stazione di pesca | |
| 2013 | StreetPass Mansion / Monster Manor | |
| 2014 | Hi-sCoool! Ragazze SeHa | Voce recitante ("Center-sensei") |
| 2015 | Rodea the Sky Soldier (versione originale Wii) | Produttore |
| StreetPass Fishing / Ultimate Angler | ||
| 2016 | StreetPass Chef / Feed Mii | |
| 2017 | Leggenda della moneta |