Il libro ha due parti. La prima parte si chiama "Ishi the Yahi". Racconta la storia e la cultura del popolo Yahi. La seconda parte si chiama "Mister Ishi". Racconta la sua vita al museo.
La prima parte inizia con la storia della California prima della colonizzazione europea. Kroeber scrive che anche se c'erano pochi Yahi, una volta occupavano gran parte della valle del Sacramento. Altri popoli nativi americani, più numerosi, probabilmente spinsero gli Yahi sulle montagne. La prima parte descrive anche la lingua Yahi e il paesaggio dove vivevano vicino al Monte Lassen.
Diversi capitoli della prima sezione riguardano la distruzione degli Yahi da parte dei coloni bianchi. La seconda parte del libro inizia con la storia del museo di San Francisco dove Ishi è stato portato. Racconta anche come ha ottenuto il nome Ishi. Al museo, Alfred Kroeber e altri organizzarono delle dimostrazioni pubbliche settimanali. Ishi di solito dimostrava di incordare un arco o di fare il fuoco con un'esercitazione antincendio. Alla fine gli amici di Ishi dovettero fare in modo che Ishi lavorasse come custode, così l'Università avrebbe pagato per mantenerlo. Oltre a Kroeber, Waterman e Pope, Ishi divenne amico di altri nativi americani amici degli antropologi, come Juan Dolores, un indiano Tohono O'odham. Ishi passava molto del suo tempo al museo a costruire strumenti e armi. Andava anche a caccia con i suoi amici. L'ultimo capitolo del libro racconta che Ishi si ammalò di tubercolosi alla fine del 1914 e che morì per la malattia poco dopo.
