Fallin non ha cercato la rielezione nel 2006 come vice governatore. Ha corso per il seggio del 5° distretto congressuale lasciato libero da Ernest Istook. Nel 25 luglio GOP primario, ha ricevuto la maggior parte dei voti. Il 22 agosto ha affrontato il secondo classificato, il sindaco di Oklahoma City Mick Cornett, nel ballottaggio dei candidati del GOP. Ha vinto con il 63% dei voti.
Fallin è stata eletta il 7 novembre, sconfiggendo il democratico Paul David Hunter. È la prima donna eletta al Congresso dall'Oklahoma dal 1921. Alice Mary Robertson è stata la prima donna ad essere eletta al Congresso degli Stati Uniti dall'Oklahoma. Si è dimessa dalla sua carica il 2 gennaio 2007 per prestare giuramento al Congresso il 4 gennaio 2007. Il vice governatore eletto Jari Askins è stato nominato dal governatore dell'Oklahoma Brad Henry per riempire i giorni rimanenti del mandato della Fallin.
Fallin ha vinto facilmente la rielezione nel 2008. Durante il suo ultimo mandato al Congresso, la Fallin ha fatto parte del Comitato della Camera sui servizi armati, del Comitato della Camera sulle piccole imprese e del Comitato della Camera sui trasporti e le infrastrutture.