Il Gibuti ha partecipato alle Olimpiadi estive del 2000 a Sydney, Australia, tenutesi dal 15 settembre al 1º ottobre. Questa era la quinta volta che Dijibouti andava alle olimpiadi dalla loro prima volta nel 1984 a Los Angeles. Dijibouti ha inviato due atleti alle Olimpiadi del 2000, entrambi hanno partecipato a eventi di atletica leggera. I due atleti erano: Omar Daher Gadid che ha gareggiato nella maratona maschile e Roda Ali Wais che ha gareggiato negli 800 metri femminili. Gadid non finì la maratona mentre Ali Wais non superò il primo turno del suo evento.