I viroidi sono i più piccoli patogeni infettivi conosciuti. Sono costituiti unicamente da brevi filamenti di RNA circolare a singolo filamento, senza rivestimento proteico. Sono per lo più patogeni delle piante (malattie delle piante), alcuni dei quali possono causare la perdita del raccolto. I genomi dei viroidi hanno dimensioni estremamente ridotte. Sono circa 80 volte più piccoli del virus più piccolo. Il virus dell'epatite D, patogeno dell'uomo (causa di malattie nell'uomo), è un virus a RNA difettoso simile ai viroidi.

I viroidi furono i primi "patogeni sub-virali" scoperti e nominati da Theodor Otto Diener. Era un patologo delle piante presso il centro di ricerca del Dipartimento dell'Agricoltura degli Stati Uniti a Beltsville, Maryland, nel 1971. Il primo viroide ad essere identificato fu il viroide dell'affusolamento del tubero della patata (PSTVd). Sono state identificate circa 33 specie.