L'area faceva parte della Central Australia Aboriginal Reserve quando la riserva fu creata nel 1922. Nel 1955, tuttavia, i confini della riserva furono spostati per consentire l'estrazione e la prospezione, soprattutto di nichel. Gli accampamenti minerari furono allestiti nell'area intorno a quella che oggi è Irrunytju. In risposta, le famiglie aborigene si trasferirono per stabilirsi intorno a questi campi. Alcune trovarono lavoro con i minatori e furono pagate in razioni di cibo; altre erano semplicemente lì per proteggere i luoghi di importanza spirituale dagli estranei. Alcune compagnie presero provvedimenti per assicurarsi che i loro minatori rispettassero questi siti; altre compagnie non lo fecero, e diversi siti sacri furono danneggiati durante questo periodo. L'area fu resa nuovamente parte della riserva nel 1972.
Una volta che i minatori se ne andarono, le famiglie aborigene rimasero e costruirono un insediamento permanente usando ciò che era rimasto dai campi minerari (rifugi, pozzi, ecc.). La comunità ricevette anche del denaro dal governo federale per aiutare a stabilire un insediamento permanente. La comunità fu incorporata nel 1976. Divenne membro del Consiglio di Ngaanyatjarra nel 1981.
Irrunytju è rimasto sulla terra aborigena dal 1972. Le attività economiche nell'area sono regolate dal Ngaanyatjarra Indigenous Land Use Agreement, formato nel 2006. La comunità mantiene molte attività tradizionali, come la caccia e la raccolta del bush tucker. La comunità ha un proprio centro artistico, Irrunytju Arts, dal 2001.
