La Grande macchia scura (nota anche come GDS-89) è una macchia scura su Nettuno simile nell'aspetto alla Grande macchia rossa di Giove. Fu scoperta nel 1989 dalla sonda Voyager 2 della NASA. Anche se appare simile alla macchia di Giove, che è una tempestaanticiclonica (è come un uragano), si crede che la Grande Macchia Scura sia un buco atmosferico simile al buco nello strato di ozono della Terra.

Tuttavia, l'interno delle Grandi Macchie Scure è per lo più privo di nubi, e a differenza della macchia di Giove, che dura da centinaia di anni, la loro vita sembra essere molto più breve, formandosi e scomparendo una volta ogni pochi anni circa. In base alle immagini scattate da Voyager e da allora con il telescopio spaziale Hubble, Nettuno sembra passare un po' più della metà del suo tempo con una Grande Macchia Scura.