Il dottor Tom Jackman (James Nesbitt) è un padre sposato di due figli. Ha abbandonato la sua famiglia senza spiegazioni per vivere in un appartamento seminterrato pesantemente fortificato. Assume l'infermiera psichiatrica Katherine Reimer (Michelle Ryan) per aiutarlo. Dopo aver spiegato a Katherine una serie di elaborate procedure di sicurezza, si lega a una sedia di metallo e subisce una trasformazione.
Katherine osserva che l'alter ego di Tom mostra rabbia, sensi accresciuti, forza e velocità, e un modo di fare civettuolo. Assicura a questo personaggio che manterrà i suoi segreti proprio come lei mantiene quelli di Tom. Chiede garanzie che lui non le farà del male. L'alter ego di Tom prende il nome di Hyde. I due concordano una tregua a disagio. Condividono un corpo, ma nessuno dei due ricorda cosa ha fatto l'altro mentre era in carica. Usano un microregistratore a cassette per lasciarsi messaggi a vicenda.
Quando Tom iniziò a trasformarsi nel violento Hyde, temeva per la sicurezza della sua famiglia. Ha scelto di isolarsi da loro. Fa visita a sua moglie Claire (Gina Bellman). Durante la visita, Hyde assume il controllo e viene a conoscenza della famiglia di Tom.
Miranda Callendar, interpretata da Meera Syal, è una detective impiegata da Claire. Lei dice a Tom che Jekyll e Hyde non è finzione, ma una versione di eventi reali. Miranda mostra a Tom una foto del vero dottor Jekyll che viveva a Edimburgo nel XIX secolo. Tom è sorpreso nel vedere che Jekyll gli assomiglia esattamente.
Tom è anche sorvegliato da una squadra di sicurezza privata guidata da un americano di nome Benjamin, interpretato da Paterson Joseph. La squadra lavora per i suoi ex datori di lavoro nella ditta di biotecnologie, Klein e Utterson. La squadra è diretta dal suo amico Peter Syme, interpretato da Denis Lawson.
Quando Benjamin mette in pericolo i figli di Tom, Hyde si fa valere e uccide un leone. All'ospedale viene avvicinato da Sophia, una donna anziana che sostiene di essere sua madre, ma prima che lui possa interrogarla scompare.
Tom affronta Peter, che tenta di drogarlo. Questo provoca la comparsa di Hyde che prende in ostaggio Peter e Claire. Claire sostiene che devono trovare una cura per la condizione di Tom. Hyde uccide Benjamin. Peter dice che Klein e Utterson hanno una cura da molto tempo. Tom viene catturato e chiuso in una bara di metallo.
Katherine e Miranda affrontano Peter, sostenendo di sapere la verità su Tom. Miranda pensa che Klein e Utterson abbiano accesso alla tecnologia di clonazione e che Tom sia il clone di Jekyll. Peter nega questo e ordina di portarli via per essere uccisi.
Peter rivela a Claire che il trattamento di Tom lo trasformerà in un solo personaggio. Se è Hyde, sarà tenuto per la ricerca. Prepareranno la pozione che ha trasformato il Jekyll originale in Hyde. Se è Tom, lei sarà libera di portarlo a casa. Quando la scatola viene aperta, Hyde è dominante.
In un flashback innescato dalla memoria genetica, Hyde ha una visione di un incontro tra Jekyll e Robert Louis Stevenson, l'autore di Strange Case of Dr Jekyll and Mr Hyde. Stevenson accetta di scrivere una versione fittizia del caso di Jekyll ma rivela di conoscere la verità: non c'è nessuna pozione. Invece, Jekyll è stato trasformato in Hyde dal suo amore per Alice, una cameriera della sua casa. I flashback nella vita di Tom mostrano che il suo Hyde è apparso per la prima volta durante una vacanza al mare con Claire, dopo che la coppia è stata avvicinata da dei teppisti.
Infuriato da ulteriori minacce alla famiglia di Tom, Hyde fugge da Klein e Utterson. La signora Utterson, una spietata donna americana dai capelli rossi a capo della Klein e Utterson, prende in ostaggio Claire e i suoi figli in una tenuta privata. Chiude i gemelli in versioni in miniatura della bara usata sul loro padre.
La presunta madre di Tom, Sophia, appare sul posto e aiuta Claire a fuggire dalla sua stanza chiusa a chiave. Racconta a Claire come Klein e Utterson abbiano cercato di clonare il dottor Jekyll senza successo. Claire incontra diversi dei tentativi falliti nel seminterrato dell'edificio. Sono sfigurati e in uno stato quasi vegetativo. Sophia spiega che Tom è un discendente del dottor Jekyll, attraverso Mr Hyde, e per caso "un perfetto throwback, un caso su un milione". Klein e Utterson lo avevano scoperto e lo avevano osservato da quando aveva sei mesi. Per innescare la sua trasformazione in Hyde, hanno creato un clone di Alice, la cameriera che Jekyll aveva amato. Questo clone è Claire stessa.
Hyde cerca di salvare la famiglia di Tom da Klein e Utterson. Egli uccide Peter. C'è uno stand-off, con i figli di Tom e Claire tenuti in ostaggio e soffocati. La personalità di Hyde viene apparentemente uccisa quando viene colpito da più proiettili e poi riesce ad evitare di "condividere il danno" prendendo le ferite su di sé e permettendo a Tom di assumere la sua forma sana e non danneggiata, lasciando il dottor Jackman come unica personalità.
Sei mesi dopo, Tom ha rintracciato Sophia, la donna che sosteneva di essere sua madre. Quando la interroga su suo padre, lei gli rivela di essere la discendente di Hyde. Aveva ereditato la maledizione di famiglia da lei. Mentre Tom guarda inorridito, l'impotente, stanca e grigia Sophia si trasforma nella sua versione di Hyde, la rossa signora Utterson.