Junko Itō è una linguista. È nata in Giappone e lavora negli Stati Uniti. Ha conseguito il dottorato in linguistica nel 1986 presso l'Università del Massachusetts Amherst. Il suo supervisore di dottorato era Alan Prince. È professoressa di linguistica all'Università della California, Santa Cruz. È stata presidente del dipartimento dal 1999-2006.

Si occupa principalmente di fonologia e morfologia. Il suo lavoro sulla struttura delle sillabe è ben noto. Ha studiato e scritto sul rendaku nella lingua giapponese. Il suo lavoro è stato pubblicato su Linguistic Inquiry e su altre riviste di ricerca con revisione paritaria in linguistica. Lavora spesso con un altro professore della UCSC, suo marito Armin Mester.

È la figlia del matematico Kiyoshi Itō.