I Dakota vivevano nel Wisconsin e nel Minnesota nel XVII secolo. Nel 1700 alcuni si erano trasferiti nell'attuale Dakota del Sud. Alla fine del XVII secolo, i Dakota si allearono con i mercanti francesi. I francesi cercarono di usare questa alleanza per aiutarli a controllare il commercio di pellicce del Nord America contro gli inglesi.
Guerra del Dakota del 1862
Alla fine degli anni 1850, le violazioni dei trattati da parte degli Stati Uniti e i pagamenti iniqui da parte degli agenti indiani (persone del governo che avevano il permesso di interagire con i nativi) portarono a una crescente fame e difficoltà tra i Dakota. Anche se i Dakota cercarono di negoziare con il governo degli Stati Uniti, nulla ebbe successo. Il 16 agosto 1862, un gruppo di cacciatori Dakota uccise una famiglia di coloni. Questo portò ad altri attacchi contro i coloni, e presto iniziò una vera e propria guerra. Il 5 novembre 1862, 38 guerrieri Dakota furono condannati a morte per impiccagione. Questa sarebbe poi diventata la più grande esecuzione di massa nella storia degli Stati Uniti.
Durante e dopo la rivolta, molti Dakota orientali e la loro famiglia lasciarono il Minnesota e il Dakota orientale per andare in Canada, o stabilirsi nella valle del fiume James in una riserva di breve durata. Furono poi costretti a trasferirsi nella riserva di Crow Creek sulla riva orientale del fiume Missouri. Alcuni si unirono ai Dakota occidentali e si spostarono più a ovest per aiutare le tribù Lakota a continuare la loro lotta contro l'esercito americano.
Altri rimasero in Minnesota e nell'est, in piccole riserve che esistono ancora, tra cui le riserve di Sisseton-Wahpeton, Flandreau, e Devils Lake (Spirit Lake o Fort Totten) nelle Dakotas. Alcuni si trasferirono in Nebraska, dove la tribù Santee Sioux ha oggi una riserva sulla riva sud del fiume Missouri.
Quelli che fuggirono in Canada lasciarono nove piccole riserve per le loro famiglie in Manitoba (Sioux Valley, Long Plain, Dakota Tipi, Birdtail Creek e Oak Lake [Pipestone]) e altre quattro (Standing Buffalo, Moose Woods [White Cap], Round Plain [Wahpeton] e Wood Mountain) in Saskatchewan.