Il ladro di fulmini
Annabeth appare per la prima volta ne Il ladro di fulmini e ha dodici anni. È stata soprannominata "Wise Girl" da Percy, in uno sputo di insulti. Il nome era inteso come un insulto, ma ora è un affettuoso nomignolo.
Incontra per la prima volta Percy Jackson dopo che è stato attaccato dal Minotauro e si fa strada verso Half-Blood Hill. Quando l'ha vista per la prima volta, Percy ha descritto Annabeth come "carina" con i capelli biondi arricciati "come quelli di Cenerentola" Dopo che Percy guarisce dall'attacco del Minotauro, Annabeth sente che lui deve partire per una ricerca (search) e lei vuole andare con lui, pensando che Percy sia "quello giusto" de La Grande Profezia. Insieme, lei, Percy e Grover vanno alla ricerca del fulmine rubato da Zeus. Nel corso del libro, Annabeth mostra la sua intelligenza unica, che ha ereditato da sua madre, e anche la sua aracnofobia (paura dei ragni) che condivide con tutti i suoi fratelli da parte di sua madre (originata dalla storia di Aracne e Atena)
Il mare dei mostri
Annabeth, Percy e Tyson, non avendo avuto il permesso di andare alla ricerca del Vello d'Oro per salvare il Pino di Thalia e trovare Grover dal temporaneo sostituto di Chiron, escono di nascosto da Campo Mezzosangue per farlo. Durante il libro viene rivelato che il più grande sogno di Annabeth è quello di riprogettare il mondo intero per migliorarlo, salvare Luke (da se stesso), ed essere accettata da sua madre e suo padre. Dopo essere rimasta bloccata sull'isola della regina-strega Circe, Annabeth salva Percy dopo averlo trasformato in un porcellino d'India usando le multivitamine date loro da Hermes. Durante il combattimento con Polifemo Annabeth (mentre è invisibile con l'uso del suo berretto da Yankee) finge di essere Nessuno e lo distrae abbastanza a lungo perché Percy possa sconfiggerlo. Annabeth viene ferita mortalmente durante il combattimento ma viene guarita con l'aiuto del Vello d'oro.
La maledizione del Titano
Annabeth viene rapita insieme alla dea Artemide e deve essere salvata da Percy, Thalia, Grover e le cacciatrici Zoë Nightshade e Bianca di Angelo. In un sogno di Percy, Annabeth è su una montagna, e vede Luke che regge un tetto nero (sconosciuto a Percy, è il cielo). Annabeth lo aiuta a tenerlo, e poi Luke scivola fuori da sotto, facendolo tenere ad Annabeth. Questo viene poi usato per ingannare Artemide a reggere il cielo, dato che Artemide non potrebbe resistere ad aiutare una fanciulla. A differenza degli altri libri, il ruolo di Annabeth è piuttosto piccolo. Si accenna in questo libro che ci sarà un futuro romantico per lei e Percy. Afrodite, la dea dell'amore, ha anche convinto Percy dei suoi sentimenti per Annabeth, anche se ha reso ancora più difficile il loro innamoramento. Alla fine, Percy salva sia Annabeth che Artemide, mentre Thalia combatte contro Luke finché non cade da una rupe.
La battaglia del labirinto
In questo libro, Annabeth ha quattordici anni. Percy e Annabeth trovano un'entrata nel Labirinto. Lei si rende conto che Luke potrebbe tentare di usare questa entrata per invadere il campo.
Annabeth guida la ricerca nel Labirinto, realizzando una delle sue ambizioni. Entra nel Labirinto con Percy, Grover e Tyson per trovare un modo per impedire alle forze malvagie di Kronos di entrare nei confini del Campo Mezzosangue, cercando l'inventore del Labirinto, Dedalo. La profezia che l'Oracolo le ha dato sembra averla spaventata e lei si rifiuta di dire l'ultima riga. Mentre si addentrano nel Labirinto, affrontano molte difficoltà. Annabeth affronta una Sfinge e trova gli indovinelli (che in realtà sono domande concrete) poco stimolanti e un insulto al suo intelletto. Sfuggono agli artigli della Sfinge e proseguono per trovare Efesto in modo che possa dire loro dove trovare Dedalo.
Mentre si dirigono verso la fucina di Efesto sul monte St. Helens, vi trovano delle telecine che costruiscono un'arma per Kronos. Percy dice ad Annabeth di scappare finché può. Lei lo bacia come portafortuna e si separano. Annabeth crede che lui muoia quando il monte St. Helens erutta, ma non è così. Percy cade sull'isola Ogygia, prigione della ninfa Calipso, figlia di Atlante. Quando Percy torna al campo, Annabeth sta eseguendo un rituale funebre per lui. Quando si accorge di lui, lo abbraccia, facendo una scenata. Tuttavia, quando scopre di Calypso, è molto gelosa. Percy chiede allora a una ragazza mortale, Rachel Elizabeth Dare, di aiutarli nel loro cammino attraverso il Labirinto (Rachel ha la rara capacità di vedere attraverso la Nebbia). Annabeth diventa molto gelosa di quanto Percy e Rachel si stiano avvicinando. I tre scoprono Luke, che è diventato il contenitore di Kronos. Dopo una battaglia, Luke è costretto a tornare nel Labirinto, lasciando due vittime. Annabeth si rifiuta di credere che Luke sia del tutto cattivo, e si arrabbia molto con Percy per aver detto il contrario.
Dopo aver compiuto la loro missione, Annabeth e Percy sono in piedi su Half-Blood Hill, e stanno abbinando i loro obiettivi con la profezia, Annabeth rivela l'ultima riga della sua profezia, "Perdere un amore a peggio della morte" ed è confusa, non sicura dei suoi sentimenti per Luke, o un amore segreto per Percy. Alla fine parte con suo padre per andare in una scuola privata a San Francisco.
L'ultimo olimpionico
Nel libro finale, Annabeth appare per la prima volta quando Percy ritorna dopo aver fatto saltare in aria la nave di Kronos, la Principessa Andromeda. Dopo il suo arrivo, Annabeth aiuta Percy ad ascoltare la Grande Profezia. Percy fa il bagno nel fiume Stige (sfugge per un pelo immaginando Annabeth che lo tira fuori dal fiume) e chiama Annabeth, dicendole di incontrarlo davanti all'Empire State Building con tutti i semidei del Campo Mezzosangue. Quando Annabeth e Percy vanno sull'Olimpo, incontrano Hermes, al quale Annabeth cerca di scusarsi per la trasformazione di Luke in Kronos. Hermes si arrabbia con lei e la incolpa di non aver salvato Luke. Hermes se ne va, e loro tornano dagli altri campeggiatori per difendere Manhattan e il Monte Olimpo. In battaglia, Ethan Nakamura tenta di pugnalare Percy nella parte bassa della schiena, il suo punto di Achille, e Annabeth gli salta davanti, prendendo il coltello. Dopo qualche ora di riposo, Annabeth, anche se ancora debole per il veleno, torna in battaglia. Kronos va sull'Olimpo e Grover, Thalia, Percy e Annabeth lo seguono. Kronos attacca Percy, e Annabeth si unisce alla battaglia, ma viene messa fuori combattimento quando Kronos la sbatte contro il trono di Atena. Alla fine, salva Percy e l'Olimpo realizzando finalmente il vero significato della profezia. Convince Percy a dare a Luke il suo coltello (che le era stato dato da Luke quando aveva sette anni) in modo che lui possa pugnalarsi, uccidendosi e bandendo Kronos nel Tartaro ancora una volta. Viene ricompensata dagli dei, che le permettono di usare il suo talento di architetto per ricostruire il Monte Olimpo. Percy Jackson rifiuta l'immortalità a causa dei suoi sentimenti per Annabeth. Al Campo Mezzosangue nella sala da pranzo più tardi quel giorno, Annabeth bacia Percy dopo che lui ammette i suoi sentimenti per lei. Lei lo avverte che non gli renderà mai le cose facili. Dopo questo, si baciano sott'acqua dopo che degli origliatori li gettano nel lago della canoa.
Magnus Chase e gli dei di Asgard
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Magnus Chase e gli dei di Asgard, libro 1 La spada dell'estate
Annabeth appare in questo libro alla ricerca, con suo padre, del cugino Magnus.
Magnus Chase e gli dei di Asgard, libro 2 Il martello di Thor
Percy appare alla fine del libro quando Magnus Chase viene a sapere che deve andare in un posto chiamato "Nave dei morti". Va a chiedere consigli ad Annabeth, nella quale Annabeth cita "Non so molto del mare, ma il mio ragazzo sì". "È ora che tu conosca Percy..."
Magnus Chase e gli dei di Asgard, libro 3 La nave dei morti
All'inizio del libro il primo capitolo si chiama "Percy Jackson fa del suo meglio per uccidermi". Annabeth e Percy danno consigli sul mare e diventano un po' pruriginosi perché Magnus fa schifo a tutto ciò che riguarda l'oceano, facendosi quasi uccidere.