Un periodo di incubazione è il tempo che intercorre tra il giorno in cui una persona viene infettata da un agente patogeno (qualcosa che causa una malattia, come un virus), e il giorno in cui la persona inizia ad avere i sintomi della malattia. Per esempio, se una persona viene infettata dal comune raffreddore, di solito ci vogliono da uno a tre giorni per iniziare ad avere i sintomi del raffreddore. Questo significa che il periodo di incubazione del raffreddore comune è da uno a tre giorni.
Con alcune malattie, come il virus dell'immunodeficienza umana (HIV, il virus che causa l'AIDS), una persona può ancora trasmettere l'HIV ad altre persone durante il periodo di incubazione. Anche se la persona con l'HIV non ha sintomi, il virus sta facendo copie di se stesso durante il periodo di incubazione.