Atene era la più grande potenza marittima e Sparta la più grande potenza terrestre nella Grecia del V secolo a.C.
Nella prima fase, la guerra di Archidamia, Sparta lanciò ripetute invasioni dell'Attica, mentre Atene approfittò della sua supremazia navale per razziare le coste del Peloponneso nel tentativo di sopprimere i segni di disordini nel suo impero.
Questo periodo della guerra terminò nel 421 a.C., con la firma della Pace di Nicia. Quel trattato, tuttavia, fu presto minato da nuovi combattimenti nel Peloponneso. Nel 415 a.C. Atene inviò una grande forza, organizzata da Alcibiade, per attaccare Siracusa in Sicilia. L'attacco fallì, con la distruzione dell'intera forza, nel 413 a.C.
La fase finale della guerra è chiamata Guerra Decretale, o Guerra Ionica. In questa fase Sparta, che ora riceveva l'appoggio della Persia, sostenne le ribellioni negli stati soggetti di Atene nel Mar Egeo e in Ionia, minando l'impero di Atene. Alla fine Atene perse la sua supremazia navale. La distruzione della flotta ateniese in una battaglia nel 405 a.C. pose effettivamente fine alla guerra, e Atene si arrese l'anno successivo.