La baia di San Francisco è un estuario poco profondo e produttivo attraverso il quale l'acqua che drena circa il quaranta per cento della California, scorrendo nei fiumi Sacramento e San Joaquin dalle montagne della Sierra Nevada e dalla Central Valley, entra nell'Oceano Pacifico. Tecnicamente, entrambi i fiumi confluiscono nella Baia di Suisun, che aiuta ad attraversare lo Stretto di Carquinez per incontrarsi con il Napa River all'ingresso della Baia di San Pablo, che nella sua estremità meridionale si collega alla Baia di San Francisco, anche se l'intero gruppo di baie interconnesse è spesso indicato come "la Baia di San Francisco".
La baia di San Francisco si trova nello stato americano della California ed è circondata da una regione conosciuta come la San Francisco Bay Area, che si trova vicino alle grandi città di San Francisco, Oakland e San Jose.
La Baia si estende tra le 400 [1] e le 1.600 [2] miglia quadrate (da 1.040 a 4.160 chilometri quadrati), a seconda di quali baie secondarie (come la Baia di San Pablo), estuari, zone umide e così via sono incluse nella misura.
