Il fiume San Joaquin è uno dei due principali fiumi della California, negli Stati Uniti. Con le sue 330 miglia (530 km) di lunghezza, è il secondo fiume più lungo della California, dopo il Sacramento River. Inizia sulle montagne della Sierra Nevada occidentale e scorre verso ovest e nord fino alla sua fine nella baia di San Francisco, sul delta del Sacramento-San Joaquin. Il suo bacino, che ha una superficie di circa 32.000 miglia quadrate (82.879 chilometri quadrati), contiene per lo più terreni agricoli. Il fiume fornisce acqua potabile a oltre 22 milioni di cittadini californiani. I suoi tre maggiori affluenti sono i fiumi Merced, Tuolumne e Stanislaus.
Un tempo il fiume era uno dei più ricchi ecosistemi fluviali della California. Tuttavia, ora più di 60 miglia (97 km) del fiume sono asciutte, tranne che durante le inondazioni, perché è stata tolta molta acqua per l'irrigazione. Infatti, sotto la diga di Friant, una diga costruita negli anni '40 sul fiume San Joaquin, il 95% della portata del fiume è asciutto. Gran parte del fiume è inquinato, distruggendo la storica popolazione di salmoni chinook, un tempo la più meridionale degli Stati Uniti. Pesticidi, selenio e molti altri materiali tossici sono trasportati dal San Joaquin nella baia di San Francisco.
Ora, è stato avviato uno dei più grandi progetti del West americano per il ripristino del fiume San Joaquin. Il 13 settembre 2006, il Natural Resources Defense Council ha firmato un accordo con gli utenti della diga di Friant e con il Dipartimento dell'Interno degli Stati Uniti. L'accordo prevede il ripristino del fiume San Joaquin sotto la diga, riducendo l'inquinamento.
