1884–1989
Il club fu fondato nel 1884 a seguito di una separazione da una squadra locale chiamata Heather Rangers. Nel 1890, i Warriors si trasferirono a Ochilview Park, dopo aver vissuto a Tryst Park e Goschen Park. All'inizio del 20° secolo il club ebbe un breve periodo di successo, vincendo la Coppa di qualificazione scozzese due volte nel 1901 e 1902. Nel 1902-03, il club raggiunse la semifinale della Coppa di Scozia, perdendo 1-4 in casa contro i Rangers. La stagione 1921-22 vide Stenhousemuir competere per la prima volta nel campionato scozzese senior di calcio.
Nel 1925-26, al portiere di Stenhousemuir Joe Shortt fu offerta una tangente di 50 sterline per lanciare una partita contro Broxburn, ma lui rifiutò l'offerta e i Warriors vinsero la partita 6-2. Un allibratore di Bainsford, un piccolo villaggio alla periferia di Falkirk, fu successivamente incarcerato per tentata combine di partite. []
Nel 1928, la tribuna di legno di Ochilview Park bruciò in un incendio, che portò alla costruzione di un nuovo stand al suo posto, anche se le scale dovettero essere aggiunte più tardi a causa di errori di pianificazione. Durante la stagione 1936-37 il club registrò una vittoria record - un 9-2 contro il Dundee United. Più di un decennio dopo, nel 1949-50, un quarto di finale di Coppa di Scozia contro l'East Fife ha attirato una folla record di 12.500 persone, la più alta mai vista a Ochilview Park. []. Nel novembre 1951, la prima partita illuminata tra due squadre scozzesi senior avvenne a Ochilview Park, tra Stenhousemuir e Hibernian. []
Nell'estate del 1964, il Rangers FC rivelò un piano alla Scottish Football League per rimuovere i Warriors dal campionato, insieme ad altri quattro club, sulla base del fatto che erano i club più poveri di supporto nelle tre stagioni precedenti. Quattro anni dopo, Stenhousemuir, insieme ad Albion Rovers, Berwick Rangers, Brechin City e Stranraer, con il sostegno di un certo numero di club, tra cui Celtic F.C., Hamilton Academical F.C. e Airdrieonians F.C., sconfisse con successo questo piano.
Nel 1972-73, i Warriors sconfissero i Rangers per 2-1 all'Ibrox Stadium nella Scottish League Cup. In particolare, i Rangers erano i detentori della Coppa delle Coppe UEFA all'epoca. []
1990-oggi
Nel 1992-93, la squadra permise ai loro rivali Stirling Albion di condividere il loro stadio Ochilview Park. Nella stagione 1993-94, i Warriors uscirono per la prima volta dalla lega inferiore, a causa della formazione della Scottish Third Division. La metà degli anni '90 fu uno dei periodi di maggior successo del club nella sua storia; nel 1994-95 sconfissero il St. Johnstone per 4-0 e l'Aberdeen per 2-0, entrambi avversari di serie superiore, raggiungendo i quarti di finale della Scottish Cup. Nella stagione 1995-96, Stenhousemuir ha vinto la Scottish Challenge Cup, sconfiggendo il Dundee United 5-4 ai rigori dopo 90 minuti senza reti e tempi supplementari. Nel processo, raggiungendo la loro prima semifinale nazionale dal 1902.
Stenhousemuir fu retrocesso dalla Scottish Second Division alla Scottish Third Division per la prima volta nella storia del club. [] Tuttavia, la stagione successiva vincendo la promozione torna in Second Division, anche questo un primo nella sua storia.
Nel 2006-07, il club ha annunciato un piano per posare erba "finta" a Ochilview Park. È diventato il primo nel Regno Unito a passare l'accreditamento della categoria FIFA 2 Star.
Stenhousemuir sono stati promossi in Scottish Second Division dopo aver sconfitto Cowdenbeath 5-4 ai rigori dopo aver pareggiato 0-0 in aggregato nella finale dei play-off alla fine della stagione 2008-09. La stagione 2010-11 ha visto il club evitare per un pelo la retrocessione dopo aver trascorso la maggior parte della stagione in zona retrocessione. Nell'ultima giornata della stagione il club ha sconfitto il Peterhead 3-0 per superare l'Alloa Athletic e quindi ha evitato gli spareggi per la retrocessione.
Per la stagione 2011/2012, l'Home Kit è sponsorizzato da Figure 11 Communications Ltd, l'Away Kit è sponsorizzato da Apex Hotels, e il retro del kit sponsor è Wright & MacLennan.
