Hermann Emil Fischer (9 ottobre 1852 - 15 luglio 1919) è stato un chimico tedesco che vinse il premio Nobel per la chimica nel 1902.

Fischer fu il fondatore della chimica dei prodotti naturali primari: carboidrati, purine e nucleosidi, peptidi e proteine. Tra le sue numerose scoperte c'era la struttura dei carboidrati, e fu il primo ad ottenere peptidi sintetici. Studiò i principi attivi del tè, del caffè e del cacao, cioè la caffeina e la teobromina.

Fischer ha anche proposto il modello lock & key dell'azione enzimatica.