Cheminformatica

Il termine chemioinformatica è stato definito da F.K. Brown nel 1998:

La cheminformatica combina i campi di lavoro scientifici della chimica e dell'informatica. La cheminformatica può anche essere applicata all'analisi dei dati per l'industria della carta, della cellulosa e dei coloranti.

Immagazzinamento e recupero

L'applicazione primaria della cheminformatica è la memorizzazione delle informazioni relative ai composti. La ricerca efficiente di tali informazioni memorizzate include argomenti che sono trattati in informatica come il data mining e il machine learning.

Formati di file

I computer rappresentano le strutture chimiche in formati specializzati come il Chemical Markup Language basato su XML o SMILES. Mentre alcuni formati sono adatti per rappresentazioni visive in 2 o 3 dimensioni, altri sono più adatti per studiare le interazioni fisiche, la modellazione e gli studi di docking.

Biblioteche virtuali

I dati chimici possono riguardare molecole reali o virtuali. I composti virtuali possono essere usati per esplorare lo spazio chimico e prevedere nuovi composti con le proprietà desiderate.

Librerie virtuali di classi di composti (farmaci, prodotti naturali, prodotti sintetici orientati alla diversità) sono state recentemente generate utilizzando l'algoritmo FOG (fragment optimized growth).

Screening virtuale

Invece di testare le sostanze chimiche effettive, lo screening virtuale comporta lo screening dei composti tramite computer, per identificare i membri che probabilmente possiedono le proprietà desiderate come l'attività biologica contro un dato bersaglio.

Relazione quantitativa struttura-attività (QSAR)

Si tratta di prevedere l'attività dei composti a partire dalle loro strutture. Questi studi collegano la cheminofrmatica alla chemiometria. Anche i sistemi esperti chimici sono rilevanti. Essi rappresentano parti della conoscenza chimica nei computer.