Il Río Negro è lungo 750 chilometri. Il suo bacino idrografico copre 70.714 km2 (27.303 sq mi), la maggior parte in territorio dell'Uruguay; solo 2.500 km2 (965 sq mi) sono in Brasile.
La sua portata media annuale (volume d'acqua che passa attraverso una sezione del fiume per unità di tempo) è di 226 m3/s (8.000 cu ft/s) (70 anni) alla diga di Palmar, 72 km a est della città di Mercedes, dipartimento di Soriano.
Scarico medio mensile (m3/s) a Palmar
Corso
Il Río Negro inizia nel comune di Bagé, stato di Rio Grande do Sul, Brasile. Scorre da nord-est a sud-ovest attraverso l'Uruguay e divide il paese in due parti: la parte settentrionale con 6 dipartimenti e la parte meridionale (leggermente più grande) con i 13 dipartimenti rimanenti.
Il suo corso forma il confine dei dipartimenti:
- Sul suo lato nord (destra): Rivera, Tacuarembó e Río Negro.
- Sul suo lato sud (sinistra): Cerro Largo, Durazno, Flores e Soriano.
Alla sua fine, a sud della città di Fray Bentos nel dipartimento del Río Negro, il Río Negro sfocia nel fiume Uruguay come affluente di sinistra. Il fiume ha molti meandri lungo il suo corso e su questo fiume sono state costruite tre dighe idroelettriche che formano tre laghi artificiali (o serbatoi in questo caso), da nord-est a sud-ovest:
- Serbatoio Rincón del Bonete, chiamato anche Serbatoio Gabriel Terra o Serbatoio Río Negro;
- Diga di Baygorria; e il
- Palmar o diga della Costituzione.
Le principali città lungo il fiume:
- Dipartimento di Tacuarembó
- Paso de los Toros.
- San Gregorio de Polanco.
- Dipartimento Soriano
- Mercedes, capitale del dipartimento.
- Villa Soriano, una delle città più antiche dell'Uruguay; si trova vicino alla foce del fiume Río Negro.