Le Isole Yaeyama (八重山諸島 Yaeyama-shotō, anche 八重山列島 Yaeyama-rettō, Yaeyama: Yaima Okinawan: Eema) sono un arcipelago o un gruppo di isole nel sud-ovest della prefettura di Okinawa, Giappone. Si estendono per 591,46 kmq (228,36 kmq). Le isole sono a sud-ovest delle Isole Miyako. Fanno parte dell'arcipelago delle Isole Ryukyu. Le Isole Yaeyama sono la parte più remota del Giappone rispetto alle isole principali. Contengono le isole abitate più meridionali (Hateruma) e più occidentali (Yonaguni) del Giappone. La città di Ishigaki è il capo politico, culturale ed economico delle Isole Yaeyama.

Le isole Yaeyama hanno numerose specie di piante subtropicali e foreste di mangrovie. Le isole producono canna da zucchero e ananas. Le barriere coralline intorno alle isole sono habitat ideali per delfini, tartarughe marine e pesci più grandi come le mante e gli squali balena. Prima di essere spazzati via dall'uomo, le balene e i dugonghi erano comuni. Yaeyama una volta aveva la più grande popolazione di dugonghi delle isole Ryukyu. Sull'isola di Aragusuku c'è un Utaki che ha messo a riposo i dugonghi con i loro teschi. I non residenti non possono entrare a meno che non ricevano un'autorizzazione dalla gente del posto. Si dice che tutti gli alieni senza permesso saranno cacciati con la forza.