Drosophila pseudoobscura è una specie di mosca della frutta, ampiamente utilizzata negli studi di laboratorio della genetica delle popolazioni naturali.

Fu usato per la prima volta da Teodosio Dobzhansky e dai suoi colleghi. Raccolsero campioni da popolazioni del Nord America occidentale e del Messico e li fecero crescere in "gabbie per la popolazione" in laboratorio. Erano interessati alla selezione naturale, alla deriva genetica e ad altri aspetti della genetica delle popolazioni.

Nel 1989 Diane Dodd ha dato alle popolazioni di laboratorio di D. pseudoobscura due diversi tipi di alimenti, amido e maltosio. Si sono rapidamente evoluti in due gruppi distinti dopo solo otto generazioni con i diversi alimenti. Come i due gruppi entrambi hanno mostrato una forte preferenza per l'accoppiamento con il proprio tipo, questo è stato sostenuto come un esempio di speciazione da isolamento riproduttivo. L'esperimento di Dodd è stato ripetuto da altri, e funziona con altri tipi di moscerini della frutta e gli alimenti.

Nel 2005, D. pseudoobscura è stata la seconda specie di Drosophila ad avere il suo genoma sequenziato, dopo Drosophila melanogaster.