Ci sono ora numerosi esempi di selezione naturale nelle popolazioni naturali.
Resistenza agli antibiotici
Un noto esempio di selezione naturale in azione è lo sviluppo della resistenza agli antibiotici nei microrganismi. Dalla scoperta della penicillina nel 1928 da parte di Alexander Fleming, gli antibiotici sono stati utilizzati per combattere le malattie batteriche. Le popolazioni naturali di batteri contengono, tra il loro vasto numero di singoli membri, una notevole variazione nel loro materiale genetico, come risultato di mutazioni. Quando sono esposti agli antibiotici, la maggior parte dei batteri muore rapidamente, ma alcuni hanno mutazioni che li rendono leggermente meno suscettibili. Se l'esposizione agli antibiotici è breve, questi individui sopravviveranno al trattamento. L'eliminazione di individui che non hanno alcuna resistenza è un esempio di selezione naturale.
Con il tempo necessario e l'esposizione ripetuta all'antibiotico, emergerà una popolazione di batteri resistenti agli antibiotici. Questo porta a quella che è conosciuta come una corsa agli armamenti evolutiva, o co-evoluzione, in cui i batteri continuano a sviluppare ceppi meno sensibili agli antibiotici, mentre i ricercatori medici continuano a sviluppare nuovi antibiotici che possono ucciderli. Le strategie di risposta includono tipicamente l'uso di diversi antibiotici più forti; tuttavia, recentemente sono emersi nuovi ceppi di MRSA che sono resistenti anche a questi farmaci. Una situazione simile si verifica con la resistenza ai pesticidi nelle piante e negli insetti e con la resistenza malarica al chinino.
Camouflage
Un caso di studio famoso è lo studio dell'evoluzione della falena pepata, e ci sono molti altri esempi. La maggior parte di queste falene che volano di giorno erano di colore chiaro, ma solo alcune di esse erano scure. All'inizio, le falene di colore chiaro sopravvivevano meglio perché erano mimetizzate contro il colore chiaro degli alberi vicini. Questo rendeva difficile agli uccelli vederle.
Quando le fabbriche furono costruite, l'inquinamento fece apparire tutti gli alberi neri. Ora le falene di colore chiaro erano evidenti contro la corteccia scura. Le falene di colore scuro avevano il vantaggio dopo che l'ambiente era cambiato. I geni che controllano il colore scuro si sono diffusi nella popolazione di falene. Dopo la seconda guerra mondiale, i controlli contro l'inquinamento lavorarono per rendere l'ambiente più pulito. Poi le falene più chiare hanno avuto ancora una volta il vantaggio, e ora sono molto più comuni.
Il mimetismo è un altro esempio: Alcuni insetti innocui imitano altri insetti che sono pericolosi, o che hanno un sapore sgradevole. Il mimetismo si evolve perché i migliori mimi sopravvivono meglio. Vivono per produrre più prole rispetto ai meno bravi che imitano. I geni dei migliori imitatori diventano più comuni nella specie. Con il tempo, le specie imitatrici si avvicinano ai loro modelli.