Scott è nato a Londra, unico figlio dell'esploratore antartico Robert Falcon Scott (Scott of the Antarctic) e della scultrice Kathleen Bruce. Aveva due anni quando suo padre morì. Robert Scott, in un'ultima lettera alla moglie, le consigliò di "far interessare il ragazzo alla storia naturale, se puoi; è meglio dei giochi".
È stato educato alla Oundle School e al Trinity College di Cambridge, all'inizio prendendo Scienze Naturali ma laureandosi in Storia dell'Arte nel 1931. Dopo la laurea, ha studiato arte in Germania e a Londra.
Ha avuto la sua prima mostra a Londra nel 1933, e ha venduto i suoi primi dipinti. Nel 1935 pubblicò Morning Flight, illustrato da lui stesso. Da giovane, Scott non era ricco, e il reddito dei suoi dipinti era la base della sua vita. I quadri stessi si vendevano bene, ma la maggior parte delle entrate proveniva dai libri e dalle riproduzioni. Le riproduzioni, che furono stampate da Ankermann di Bond Street, si vendono ancora bene. Da questo "flusso di reddito" Scott fu in grado di mantenere una famiglia, e di comprare alcuni dei terreni che voleva per i rifugi per uccelli selvatici.
Nei giochi olimpici di Berlino del 1936, rappresentò la Gran Bretagna a vela, vincendo una medaglia di bronzo nella classe di barche più piccola, la O-Jolle o dinghy.
Seconda Guerra Mondiale
Con l'avvicinarsi della guerra, nel 1939, si unì alla Royal Naval Volunteer Reserve. Nel 1940 era in un cacciatorpediniere come tenente. Dopo essersi unito alle forze costiere, divenne tenente comandante e comandò una flottiglia di motoscafi nella Manica. Fu premiato con la Distinguished Service Cross con barra e un MBE (Military Division). Nel 1944 fu ufficiale di stato maggiore e nel marzo 1945 fu nominato capitano della nuovissima fregata HMS 'Cardigan Bay'.