La prima parte della metropolitana, che ha sostituito un tram molto trafficato, ha seguito Yonge Street da Eglinton Avenue a sud fino a Front Street, poi ha girato verso ovest per un isolato per terminare a Bay Street, vicino alla stazione ferroviaria principale della città Union Station e quindi la stazione della metropolitana è stata chiamata anche Union. Questa linea è stata terminata nel 1954 ed era lunga 7,4 km.
Nel 1963 ne fu aggiunta un'altra parte, che andava a nord dalla Union station, sotto University Avenue e Queen's Park fino a vicino a Bloor Street, dove svoltò a ovest per terminare a St.
La Bloor-Danforth Line ha aperto nel 1966 lungo Bloor Street e Danforth Avenue da Keele Street a Woodbine Avenue, e nel 1968 è stata allungata per andare da Islington Avenue alla stazione di Warden a Warden e St.
Il tracciato della linea attraverso la valle del Don è stato possibile grazie a una scelta fatta più di quarant'anni prima. Quando nel 1919 fu costruito il viadotto del Principe Edoardo attraverso il fiume Don, il suo progetto prevedeva due ponti gemelli sotto la strada per consentire la realizzazione di future linee ferroviarie. Ciò rese possibile l'attraversamento della valle del Don da parte della metropolitana fino a Danforth Avenue sul lato est.
La linea Yonge-University è stata prolungata a nord di 8,7 km da Eglinton Avenue a Finch Avenue e Yonge nel 1973 e 1974.
Un altro tracciato (9,9 km) è stato aggiunto alla Yonge-University Line nel 1978 quando è stata estesa da St. George e Bloor, a nord e nord-ovest fino a Eglinton Avenue e Allen Road, poi a nord lungo la metà di Allen Road fino a Wilson Avenue.
Nell'ottobre 1976 un incendio doloso (un incendio doloso appiccato di proposito) distrusse i vagoni della metropolitana e danneggiò la stazione di Christie. Questo causò la chiusura della Bloor-Danforth Line per tre giorni e la chiusura della stazione di Christie per qualche tempo per le riparazioni. Altri binari sono stati aggiunti nel 1980 ad entrambe le estremità della Bloor-Danforth Line. Queste estensioni hanno aggiunto ognuna una stazione, baie per gli autobus e, all'estremità orientale, una stanza per il collegamento con la RT Scarborough.
Con sei stazioni su 6,8 km di binari, la Scarborough RT è una linea costruita quasi tutta a cielo aperto, che non ha binari diretti che si collegano alle altre linee e utilizza un treno diverso. Utilizza i treni del sistema di transito a capacità intermedia (ICTS - Intermediate Capacity Transit System) che sono molto diversi dai treni della metropolitana. Il percorso è completamente separato dal traffico stradale e dai pedoni, le stazioni sono completamente coperte e i treni hanno molte porte che utilizzano marciapiedi alti.
Un ulteriore 1,6 km è stato aggiunto all'estremità nord della parte Spadina della linea Yonge-University-Spadina, aggiungendo una stazione (Downsview), con parcheggio per gli autobus.
Nell'agosto del 1995, la TTC ha avuto un gravissimo incidente in metropolitana in quello che chiama l'incidente di Russell Hill, sulla linea Yonge-University-Spadina Line a sud della stazione di St. Tre donne morirono e 100 persone rimasero ferite, alcune gravemente.
La nuova linea della metropolitana, Sheppard, è stata inaugurata nel 2002. Corre 5,5 km ad est, sotto Sheppard Avenue, dalla stazione di Sheppard sulla linea Yonge (ora chiamata Sheppard-Yonge), fino alla stazione Don Mills a Sheppard e Don Mills Road. La linea di Sheppard ha meno utenti rispetto alle altre due linee della metropolitana, e su di essa circolano treni più corti.
In oltre cinquant'anni di storia, il primo bambino nato sulla piattaforma di una stazione della metropolitana TTC è nato solo recentemente, il 6 febbraio 2006. Questo incidente si è verificato alla stazione di Wellesley e ha causato ritardi nella metropolitana. È stata una notizia da prima pagina per molti giorni.
È stato aggiunto un sistema vocale automatico per annunciare ogni stazione (come ad esempio: "La stazione successiva è Bloor, Bloor station.") che ha posto fine alla necessità per l'operatore del treno di annunciare ogni fermata. Il sistema automatico è utilizzato in tutta la metropolitana e nel sistema RT.
