Botanica
Darwin formò la Lichfield Botanical Society per tradurre le opere del botanico svedese Carolus Linnaeus dal latino all'inglese. Questo richiese sette anni. Il risultato furono due pubblicazioni: A System of Vegetables tra il 1783 e il 1785, e The Families of Plants nel 1787. In questi volumi, Darwin coniò molti dei nomi inglesi delle piante che usiamo oggi.
Darwin scrisse poi The Loves of the Plants, un lungo poema, che era una resa popolare delle opere di Linneo. Darwin scrisse anche Economy of Vegetation, e insieme i due furono pubblicati come The Botanic Garden.
Il suo ultimo lungo poema, il Tempio della Natura, fu pubblicato dopo la sua morte, nel 1803. Questa è considerata la sua migliore opera poetica. È incentrato sulla sua teoria dell'evoluzione appena concepita, che traccia la progressione della vita dai microrganismi alla società civilizzata.
Zoologia
L'opera scientifica più importante di Darwin è Zoönomia (1794-1796), che contiene un sistema di patologia e un trattato sulla generazione, in cui anticipa alcune delle idee di Lamarck sull'evoluzione.
L'essenza del suo punto di vista è contenuta nel seguente passaggio, che segue con la conclusione che uno stesso tipo di filamento vivente è ed è stato la causa di tutta la vita organica:
Sarebbe troppo audace immaginare che, nel lungo periodo di tempo trascorso da quando la terra ha cominciato ad esistere, forse milioni di anni prima dell'inizio della storia dell'umanità, sarebbe troppo audace immaginare che tutti gli animali a sangue caldo siano sorti da un unico filamento vivente, che la grande causa prima ha dotato di animalità, con il potere di acquisire nuove parti, frequentate da nuove propensioni, dirette da irritazioni, sensazioni, voli e associazioni, e così possedere la facoltà di continuare a migliorare per la sua propria attività intrinseca, e di consegnare questi miglioramenti per generazione alla sua posterità, mondo senza fine!
Questa è una chiara dichiarazione del tipo di pensiero evolutivo per cui Lamarck è noto.
Opere successive
L'idea di Darwin dell'evoluzione è emersa in diverse altre sue opere. Negli Amori delle piante (1789), ristampato in diverse edizioni come Il giardino botanico, c'è il commento: "Forse tutte le produzioni della natura sono nel loro progresso verso una maggiore perfezione! Tutte queste opere di storia naturale sono in forma di poemi, e quindi non sono soddisfacenti dal punto di vista della scienza moderna. Ma il XVIII secolo fu un'epoca in cui gli uomini intelligenti fecero dei collegamenti; i tipi di scienziati specializzati si verificarono per primi durante la vita di suo nipote Carlo.
Gli ultimi due fogli di A plan for the conduct of female education in boarding schools (1797) di Darwin contengono una lista di libri, un'apologia del lavoro e una pubblicità per la "Miss Parkers School". L'opera è probabilmente il risultato della sua relazione con Mary Parker. La scuola pubblicizzata nell'ultima pagina è quella che egli istituì ad Ashbourne, Derbyshire, per le loro due figlie illegittime, Susanna e Mary.