La contea di Atchison (codice di contea AT) è una contea del nord-est del Kansas, negli Stati Uniti centrali. Nel 2010, vi abitavano 16.924 persone. La sede della contea è Atchison. Atchison è anche la più grande città della contea. La contea prende il nome da David Rice Atchison, un senatore degli Stati Uniti del Missouri.