Origini
Il Sinodo del Missouri fu avviato da diverse comunità di luterani tedeschi negli Stati Uniti. F. C. D. Wyneken fece lavoro di missione in Indiana, Ohio e Michigan. Martin Stephan iniziò una comunità di luterani nella contea di Perry, Missouri, e a St. Louis, Missouri. Wilhelm Löhe inviò dei missionari nel Michigan e nell'Ohio.
L'immigrazione sassone
Nel Regno di Sassonia nel XIX secolo, il pastore luterano Martin Stephan e molti dei suoi seguaci pensavano che la loro chiesa sarebbe stata costretta a fondersi con la chiesa riformata. A causa di ciò, Stephan e tra 600 e 700 altri luterani sassoni lasciarono la Germania per trasferirsi negli Stati Uniti nel novembre 1838. Avevano cinque navi.
Le loro navi arrivarono tra il 31 dicembre 1838 e il 20 gennaio 1839 a New Orleans. Una nave fu persa in mare. In seguito, si stabilirono nella contea di Perry, nel Missouri. All'inizio, Stephan era il vescovo. Più tardi, altri membri dissero che Stephan era corrotto e fornicatore, così fu cacciato. Questo rese C. F. W. Walther il nuovo leader.
I missionari di Löhe
Nel 1842, un pastore tedesco di nome Wilhelm Löhe iniziò a mandare missionari in America. Essi fondarono congregazioni in Ohio, Michigan e Indiana.
Fondazione e primi anni
Nel 1844 e 1845, i tre gruppi sopra elencati (i sassoni, i missionari di Löhe e Wyneken) iniziarono a parlare di iniziare un sinodo. Il 26 aprile 1847, dodici pastori si riunirono a Chicago, Illinois, e diedero ufficialmente inizio al Sinodo Evangelico Luterano Tedesco del Missouri, Ohio e altri Stati. Walther fu il primo presidente.
Il sinodo era conservatore. Löhe se ne andò perché non era d'accordo con alcune delle sue dottrine.
La conferenza sinodale
Nel 1857 e nel 1872, la LCMS entrò in comunione con altri cinque sinodi luterani conservatori. Questi gruppi formarono la Conferenza Sinodale Evangelica Luterana del Nord America.
Transizione inglese
Per i trent'anni successivi al suo inizio, il Sinodo del Missouri si concentrò sui luterani di lingua tedesca. Nel 1872, i membri del Sinodo del Missouri, insieme ad altri tre sinodi, fondarono la "Conferenza Evangelica Luterana Inglese del Missouri". Questo gruppo si concentrò sugli anglofoni. Divenne un sinodo indipendente nel 1888 e si fuse con la LCMS nel 1911.
L'inglese divenne più comune nella LCMS durante i primi due decenni del 20° secolo. Alcuni cattolici abbandonarono tutti i servizi in tedesco.
Dopo la seconda guerra mondiale
Nel 1947, il sinodo abbreviò il suo nome in "The Lutheran Church-Missouri Synod". Nel 1964, la National Evangelical Lutheran Church, una chiesa luterana storicamente finlandese-americana, si fuse con la LCMS. Nel 1971, il Sinodo delle Chiese Evangeliche Luterane, una chiesa storicamente slovacco-americana, si fuse con la LCMS.
La Conferenza Sinodale si sciolse nel 1963. Sei anni dopo, la LCMS formò il Consiglio Luterano negli Stati Uniti d'America (LCUSA) con diversi altri sinodi luterani. Questi erano moderati e liberali. In seguito, la LCMS cominciò a diventare di nuovo più conservatrice.
Alcuni dei professori e degli studenti più liberali lasciarono il Concordia Seminary e fondarono il Seminex. Nel 1976, circa 250 delle congregazioni più liberali lasciarono il Sinodo. Poi la LCMS lasciò la LCUSA.
