Le volpi volanti in Australia sono note per essere portatrici di due infezioni che possono rappresentare un serio rischio per la salute umana: l'Australian bat lyssavirus e l'hendra virus (Henipavirus). Queste malattie trasmesse dai pipistrelli, uniche nel Queensland, sono tra i virus più letali del mondo occidentale. Anche se rare, queste malattie continuano a mistificare i professionisti della medicina. Queste malattie trasmesse dai pipistrelli sono quasi sempre fatali. Le infezioni umane con questi virus sono fortunatamente molto rare.
Il virus Hendra è un virus che infetta principalmente i megabat (grandi pipistrelli della frutta, o "volpi volanti") che può essere trasmesso ai cavalli. Come l'ebola e il marburg, l'hendra è una febbre emorragica con una mortalità da alta a molto alta (50-90%). Sia il virus di ebola che quello di marburg sono stati associati ai megabat come vettori infettivi. Si pensa che i cavalli contraggano il virus Hendra ingerendo cibo o acqua contaminati da fluidi corporei ed escrezioni di megabat infetti. Il virus può essere mortale sia per gli esseri umani che per i cavalli. Quando non c'è manipolazione o contatto fisico diretto con le volpi volanti, il rischio per la salute pubblica è trascurabile.
Si sa che solo tre persone sono sopravvissute al virus Hendra trasmesso dai pipistrelli. Finora più della metà di tutte le persone che hanno contratto il virus Hendra sono morte entro sei settimane, tuttavia non ci sono stati sopravvissuti di una seconda malattia trasmessa dai pipistrelli del Queensland. Nel 1994 il lyssavirus - un parente stretto del virus della rabbia - è stato scoperto per la prima volta in una volpe volante che mostrava sintomi vicino a Ballina, NSW (che si trova al confine con il Queensland). Il lyssavirus ha ucciso le uniche tre persone che lo hanno contratto.
