Pandoravirus è un genere di virus molto grandi. Hanno i genomi più grandi di qualsiasi genere virale. Come gli altri grandi virus Mimivirus, Pithovirus e Megavirus, Pandoravirus infetta le amebe. Il suo genoma, con 1,9 a 2,5 megabasi di DNA, è due volte più grande di quello del Megavirus. Si differenzia molto dagli altri grandi virus nell'aspetto e nella struttura del genoma.
Anche se il capside del Pithovirus è del 50% più grande, il Pandoravirus ha il genoma più grande di tutti i virus (2,5 milioni di paia di basi).
Circa il 93% dei geni del Pandoravirus non sono conosciuti da nessun altro microbo. Questo ha portato alcuni scienziati a suggerire che il virus appartiene a un "quarto dominio", oltre a batteri, archaea ed eucarioti. I virus nel loro insieme non sono considerati all'interno di questi tre domini, ma sono stati proposti come uno in passato da alcuni biologi.