La clorofilla è necessaria per la fotosintesi, che permette alle piante di ottenere energia dalla luce.
Le molecole di clorofilla sono disposte dentro e intorno alle membrane dei cloroplasti. Svolgono due funzioni principali. La funzione della maggior parte della clorofilla (fino a diverse centinaia di molecole per fotosistema) è quella di assorbire la luce e trasferire l'energia luminosa ai centri di reazione. Questi pigmenti prendono il nome dalla lunghezza d'onda (in nanometri) del loro massimo di assorbimento del rosso. Questi pigmenti di clorofilla possono essere separati in un semplice esperimento di cromatografia su carta.
La funzione del centro di reazione della clorofilla è di usare l'energia trasferitagli dagli altri pigmenti della clorofilla per subire una specifica reazione redox. In questa reazione la clorofilla dà un elettrone a una catena di trasporto degli elettroni. Questa reazione è il modo in cui gli organismi fotosintetici come le piante producono gas O2, ed è la fonte di praticamente tutto l'O2 nell'atmosfera terrestre. Il fotosistema I lavora tipicamente in serie con il fotosistema II.
Il flusso di elettroni prodotto dai pigmenti clorofilliani del centro di reazione è usato per trasportare ioni H+ attraverso la membrana, creando un potenziale chemiosmotico usato principalmente per produrre energia chimica ATP; e quegli elettroni riducono infine NADP+ a NADPH, un riduttore universale usato per ridurre la CO2 in zuccheri e per altre riduzioni biosintetiche.
Una lumaca di mare verde, Elysia chlorotica, è stata trovata ad usare la clorofilla che ha mangiato per eseguire la fotosintesi per se stessa. Questo processo è noto come cleptoplastica, e nessun altro animale è stato trovato ad avere questa capacità.
Perché verde e non nero?
Non è ancora chiaro esattamente perché le piante si siano evolute principalmente per essere verdi. Le piante verdi riflettono principalmente la luce verde e quasi-verde piuttosto che assorbirla. Altre parti del sistema di fotosintesi permettono ancora alle piante verdi di utilizzare lo spettro della luce verde (ad esempio attraverso una struttura fogliare che trattiene la luce, carotenoidi, ecc.) Le piante verdi non utilizzano gran parte dello spettro visibile nel modo più efficiente possibile. Una pianta nera può assorbire più radiazioni, e questo potrebbe essere molto utile, senza contare i problemi di smaltimento di questo calore extra (ad esempio, alcune piante devono chiudere le loro aperture, chiamate stomi, nei giorni caldi per evitare di perdere troppa acqua). Più precisamente, la domanda diventa perché l'unica molecola che assorbe la luce usata per l'alimentazione nelle piante è verde e non semplicemente nera.
Il biologo John Berman ha detto che l'evoluzione non è un processo di ingegneria, quindi spesso ha limiti che un ingegnere o un altro progettista non ha. Anche se le foglie nere fossero migliori, i limiti dell'evoluzione possono impedire alle specie di diventare il più efficiente possibile. Berman ha scritto che ottenere pigmenti che funzionano meglio della clorofilla potrebbe essere molto difficile. Infatti, si ritiene che tutte le piante superiori (embriofite) si siano evolute da un antenato comune che è una specie di alga verde - quindi la clorofilla si è evoluta solo una volta (antenato comune).
Shil DasSarma, un genetista microbico dell'Università del Maryland, ha sottolineato che le specie di archaea usano un'altra molecola che assorbe la luce, la retina, per ottenere energia dallo spettro verde. Alcuni scienziati ritengono che le arche che assorbono la luce verde fossero un tempo le più comuni nell'ambiente terrestre. Questo potrebbe aver lasciato aperta una "nicchia" per gli organismi verdi che avrebbero assorbito le altre lunghezze d'onda della luce solare. Questa è solo una possibilità, e Berman ha scritto che gli scienziati non sono ancora convinti di nessuna spiegazione.