I cianobatteri sono un taxon di batteri che conducono la fotosintesi. Non sono alghe, anche se una volta venivano chiamate alghe blu-verdi. Si tratta di un phylum di batteri, con circa 1500 specie. Nella teoria degli endosimbrioni, i cloroplasti (plastidi) discendono dai cianobatteri. Il loro profilo del DNA ne è la prova.

I cianobatteri hanno un record di fossili estremamente lungo, a partire da almeno 3.500 milioni di anni fa. Erano i principali organismi nelle stromatoliti degli eoni arcaici e proterozoici.

La capacità dei cianobatteri di eseguire la fotosintesi ossigenica è molto significativa. La prima atmosfera sulla Terra era in gran parte riducente, cioè senza ossigeno. I cianobatteri nelle stromatoliti sono stati i primi organismi conosciuti a fotosintesi e a produrre ossigeno libero. Dopo circa un miliardo di anni, l'effetto di questa fotosintesi iniziò un enorme cambiamento nell'atmosfera. Il processo, chiamato Grande Evento di Ossigenazione, ha richiesto molto tempo. Alla fine, ha ucciso la maggior parte degli organismi che non potevano vivere in ossigeno, e ha portato al tipo di ambiente che conosciamo oggi, dove la maggior parte degli organismi usa e ha bisogno di ossigeno.