L'epistasi è l'interazione tra geni in loci diversi. È un termine inventato da William Bateson nel 1909.
Quando Gregor Mendel fece i suoi esperimenti sul pisello dolce, scelse sette tratti, come piselli rotondi o rugosi, e piante alte o corte. Trovò che le piante avevano coppie di "fattori" (geni) che controllavano il loro aspetto (fenotipo). Tuttavia, una coppia di fattori non influenzava mai le altre coppie. Ma con l'epistasi, l'azione di un gene influenza un altro gene, anche uno su un cromosoma diverso.
L'uso del termine è variato un po'. Il suo significato originale era abbastanza stretto: per esempio, un gene per l'assenza di ali nella Drosophila maschererà ovviamente i geni per qualsiasi altro aspetto delle ali. In generale, tuttavia, l'epistasi denota qualsiasi allontanamento dall'indipendenza degli effetti dei diversi loci genetici.