Le cheratine sono il principale costituente delle strutture che crescono dalla pelle:
- le α-cheratine nei capelli (compresa la lana), corna, unghie, artigli e zoccoli dei mammiferi
- le β-cheratine più dure nelle squame e negli artigli dei rettili, nei loro gusci (chelonia, come la tartaruga, la testuggine, la testuggine), e nelle piume, becchi e artigli degli uccelli. Queste cheratine sono formate principalmente in fogli beta. Tuttavia, i fogli beta si trovano anche nelle α-cheratine.
Gli artropodi come i crostacei hanno spesso parti del loro esoscheletro fatte di cheratina, a volte in combinazione con la chitina.
Le cheratine si trovano anche nei tratti gastrointestinali di molti animali, compresi i vermi (che hanno anche uno strato esterno fatto di cheratina).
Anche se ora è difficile esserne certi, le squame, gli artigli, alcune armature protettive e i becchi dei dinosauri sarebbero stati quasi certamente composti da un tipo di cheratina.