Di solito, le parole con un solo kanji sono yamato kotoba, come katana (kanji: 刀, hiragana: かたな, che significa: spada), sakana (kanji: 魚, hiragana: さかな, che significa: pesce), kami (kanji: 紙, hiragana: かみ, che significa: carta), yama (kanji: 山, hiragana: やま, che significa montagna): かみ, che significa: carta), yama (kanji: 山, hiragana: やま, che significa: montagna) te (kanji: 手, hiragana: て, che significa: mano), e oyogu (kanji e hiragana: 泳ぐ, solo hiragana: およぐ, che significa: nuotare). La maggior parte dei kanji (la versione giapponese dei caratteri cinesi) hanno due diversi tipi di pronuncia, on'yomi (la pronuncia dei kanji presi in prestito dal cinese) e kun'yomi (la pronuncia nativa delle parole giapponesi che usano i kanji). Le parole Yamato kotoba usano il kun'yomi del kanji.
Poiché gli on'yomi provengono dai monosillabi cinesi (parole con una sola sillaba), anch'essi sono di una sola sillaba e, come il cinese, possono avere una struttura CV o CVC. Per esempio, gli on'yomi per i seguenti kanji 刀, 魚, 紙, 山, 手, e 泳 sono tō, shi, san, shu, ed ei. Tuttavia, il kun'yomi può avere una o più sillabe, e queste sillabe sono di solito una struttura CV, come gli esempi riportati sopra.
Poiché il giapponese usa tre diversi sistemi di scrittura in modo intercambiabile, anche lo yamato kotoba può essere scritto in diversi modi. Per esempio, la parola sushi può essere scritta interamente in hiragana come すし, interamente in katakana come スシ, in kanji come 鮨 o 鮓, o in ateji (kanji usati solo per mostrare la pronuncia di una parola e non il suo significato) come 寿司 o 壽司.
I kanji di solito mostrano il significato della radice della parola. Mentre i sostantivi sono di solito scritti solo con i kanji, possono anche essere scritti in kana se sono parole molto comuni, come sushi, o se il loro kanji non è molto conosciuto, non fa parte del jōyō kanji (una lista standard di 1.945 kanji che tutti gli adulti giapponesi dovrebbero conoscere) o troppo difficile da ricordare come scrivere, come bara, il cui kanji è 薔薇, ma è solitamente scritto solo come ばら in hiragana o come バラ in katakana.
Il giapponese ha anche inventato molti dei propri kanji per nominare cose che si possono trovare in Giappone, ma non in Cina (di solito piante e animali). Questi sono chiamati kokuji (kanji: 国字, hiragana: こくじ) che significa "caratteri nazionali", o wasei-kanji (kanji: 和製漢字, hiragana: わせいかんじ) che significa "caratteri cinesi fatti in Giappone". I kokuji includono i nomi di pesci come iwashi (kanji: 鰯, hiragana: いわし, che significa: sardina), tara (kanji: 鱈, hiragana: たら, che significa: merluzzo), e kisu (kanji: 鱚, hiragana: きす, che significa: sillago), e alberi come kashi (kanji: 樫, hiragana: かし, che significa: quercia sempreverde), sugi (kanji: 椙, hiragana: すぎ, che significa: cedro giapponese), e kaba o momiji (kanji: 椛, hiragana: かば/もみじ, che significa: betulla/acchio). La maggior parte dei kokuji hanno solo kun'yomi perché sono yamato kotoba, ma alcuni kanji hanno anche on'yomi, come 働 (on'yomi: dō どう, kun'yomi: hatara(ku) はたら(く), cioè: lavoro), e alcuni hanno solo on'yomi, come 腺 (on'yomi: sen せん, cioè: ghiandola).