Un enterotipo è una classificazione della flora intestinale. Si basa sull'ecosistema del sistema intestinale umano. La classificazione viene fatta identificando i batteri e i protisti che ci vivono. Questo è chiamato "bioma intestinale umano".
La ricerca mostra che ci sono tre ecosistemi distinti nell'intestino delle persone. Le persone possono essere classificate in uno dei tre gruppi in base ai batteri nel loro intestino. L'enterotipo di ogni persona è impostato mentre la persona è un bambino.
L'enterotipo influenza il modo in cui una persona può digerire il cibo o assorbire i farmaci. Gli scimpanzé hanno enterotipi simili a quelli umani.
Il tipo 1 ha alti livelli di Bacteroides. I Prevotella sono comuni nel tipo 2. Il tipo 3 ha alti livelli di Ruminococcus.