Manor Farm è gestita dal signor Jones, un agricoltore crudele e ubriaco. Un giorno, gli animali si riuniscono in riunione per ascoltare il Vecchio Maggiore, un vecchio maiale saggio. Il Vecchio Maggiore fa un discorso, chiedendo agli animali di ribellarsi ai loro contadini. Gli animali sono molto entusiasti dell'idea. Il vecchio maggiore muore qualche giorno dopo. I maiali, che sono gli animali più intelligenti, iniziano a pianificare una ribellione. Sono guidati da Palla di Neve e Napoleone.
Circa tre mesi dopo, gli animali si ribellano contro il signor Jones e si impadroniscono della fattoria. Ne cambiano il nome in "Fattoria degli animali". Decidono che la fattoria sarà ora governata solo dagli animali, chiamando il sistema "animalismo". Scrivono sette comandamenti, il più importante dei quali è "Tutti gli animali sono uguali". "Quattro zampe buone, due zampe cattive" diventa un canto popolare per le pecore. Il signor Jones e i suoi amici attaccano la fattoria per cercare di riprenderla, ma nella "Battaglia della stalla" gli animali li cacciano via. Il signor Jones fugge e non torna più.
Palla di neve e Napoleone litigano tra loro, poiché hanno idee diverse su come si dovrebbe condurre la Fattoria degli animali. Palla di Neve annuncia il progetto di costruire un mulino a vento, ma Napoleone non è d'accordo. Napoleone addestra nove cuccioli, che diventano cani feroci che lo serviranno. Quando i cani sono completamente cresciuti, li usa per cacciare Palla di Neve dalla fattoria. Prende il controllo e governa la fattoria da solo (come un dittatore). Napoleone usa i cani per uccidere qualsiasi animale che non è d'accordo con lui, mentre un maiale di nome Squealer continua a dire agli animali che tutto va bene e che dovrebbero sostenere Napoleone.
Napoleone cambia idea e decide di costruire un mulino a vento, fingendo che sia sempre stata una sua idea. Il primo mulino a vento che costruiscono crolla. Napoleone dà la colpa di questo (e di altri problemi) a Palla di Neve. Sostiene che Palla di Neve si aggira furtivamente per la Fattoria degli Animali rovinando tutto. Molti animali vengono uccisi per "essere entrati in contatto con Palla di Neve". Napoleone inizia a lavorare con gli esseri umani all'esterno, anche se questo era proibito. Uno di loro è il loro vicino, un contadino di nome Frederick. Egli porta un gruppo di uomini che invadono la fattoria e distruggono il secondo mulino a vento. Gli animali li combattono nella "Battaglia del Mulino a vento", a caro prezzo.
Mentre gli animali costruiscono un terzo mulino a vento, Boxer, il loro cavallo più forte, perde le forze a causa della vecchiaia e crolla. Napoleone lo manda a macellare, anche se Boxer era suo amico. I maiali continuano a lavorare con gli umani e cominciano a comportarsi come loro, come vivere nella fattoria e camminare su due zampe. Insegnano alle pecore un nuovo canto: "Quattro zampe bene, due zampe meglio". I comandamenti sono sostituiti dalle parole "Tutti gli animali sono uguali, ma alcuni animali sono più uguali di altri". Alla fine, altri animali guardano i maiali parlare con un gruppo di umani e decidono che non sanno dire chi è chi.