Primo regno
Guglielmo scelse di essere incoronato a Natale. In parte perché pensava che gli inglesi avrebbero avuto meno probabilità di ribellarsi in questo giorno di festa. Era anche una buona scelta perché credeva che fosse la volontà di Dio che lui fosse re. Ora il re, Guglielmo trascorse alcuni mesi in Inghilterra. Poi tornò in Normandia lasciando l'Inghilterra nelle mani di due uomini capaci. Questi erano il suo fratellastro Odo, il vescovo di Bayeux e William FitzOsbern. Odo fu nominato conte di Kent, mentre FitzOsbern divenne conte di Hereford. I restanti tre conti inglesi furono lasciati al loro posto. Quando Guglielmo salpò per tornare in Normandia con lui c'erano molti dei suoi seguaci. Molti dei suoi soldati che erano stati pagati e altri di cui voleva tenere traccia. In particolare questi erano l'arcivescovo inglese Stigand e Edgar Atheling. Portò anche i suoi tre conti inglesi rimasti, Edwin, Morcar e Waltheof. Questo perché nessuno di loro potesse iniziare una rivolta mentre lui era via. Guglielmo aveva i suoi doveri a casa di cui occuparsi. Inoltre molti dei suoi soldati dovevano tornare per mantenere il ducato al sicuro.
Quando Guglielmo tornò a Londra nel dicembre del 1067 cominciò a scoprire quali problemi erano sorti mentre era via. L'Hertfordshire era stato razziato dai Merciani. Poi Exeter non aveva accettato il governo del nuovo re. Guglielmo raccolse denaro da tutte quelle parti dell'Inghilterra che avrebbero pagato. Richiamò anche i prelievi inglesi. Exeter si arrese dopo che uno dei suoi ostaggi fu accecato. Dopo aver sottomesso il Devon e la Cornovaglia tutto sembrava tranquillo. A Winchester William mandò a chiamare sua moglie Matilda, che fu incoronata regina d'Inghilterra a Pentecoste.
In estate erano scoppiate altre ribellioni. Allo stesso tempo altri stavano fuggendo dall'Inghilterra. Edgar Atheling insieme a sua madre e alle sue sorelle partì per la Scozia dove furono accolti. Nel nord si stavano radunando forti gruppi anti-normanni intorno a York. Il conte Edwin e suo fratello Morcar lasciarono la corte di Guglielmo per unirsi ai ribelli del nord. Guglielmo costruì allora un castello a Warwick. Questo indusse i conti e gli altri a cedere a Guglielmo. Seguirono altri castelli. Guglielmo entrò poi a York dove altri vennero da lui e si sottomisero. Poi negoziò con il re di Scozia per prevenire qualsiasi invasione dell'Inghilterra dal nord. Ma la sua campagna nel nord non fu così efficace come pensava. Nel 1069 una seconda rivolta si trasformò in una guerra. Gli uomini che William aveva lasciato al comando erano stati uccisi. Una piccola forza normanna resisteva a York quando Guglielmo venne in loro aiuto. Dopo aver costruito un altro castello Guglielmo lasciò in carica il conte William FitzOsbern. Per i successivi cinque mesi il nord fu tranquillo. Ma i capi inglesi del nord avevano mandato un messaggio al re Swein in Danimarca offrendogli la corona se fosse riuscito a sconfiggere i Normanni. Swein inviò una flotta danese in Inghilterra.
Nell'estate del 1069 la flotta danese apparve al largo della costa del Kent. Risalì la costa verso nord, compiendo incursioni. Guglielmo e il suo esercito erano a sud a fare la guardia contro qualsiasi incursione. Alla fine la flotta si unì ai ribelli inglesi sulle rive del fiume Humber. I restanti conti inglesi disertarono tutti da Guglielmo e si unirono alle forze combinate inglesi-danesi. Essi si mossero contro la guarnigione normanna di York e uccisero tutti tranne alcune donne e bambini. Anche William Malet, un normanno che aveva vissuto in Inghilterra prima del 1066, fu risparmiato.
Harrying del nord
L'esercito settentrionale di Guglielmo fu spazzato via e York era in rovina. Allo stesso tempo piccole ribellioni stavano scoppiando nel Galles e nel sud-ovest dell'Inghilterra. Guglielmo sapeva di essere nei guai. Cominciò a chiamare tutti i suoi comandanti e le sue truppe per unire le forze. Il re sapeva che con un esercito più piccolo doveva affrontare un gruppo di ribelli alla volta. Mandò Guglielmo FitzOsbern e Brian di Bretagna ad affrontare Exeter. Lo stesso Guglielmo combatté un'armata che si muoveva da est. In entrambi i casi gli eserciti normanni furono vittoriosi. Ora si mosse contro le armate del nord che avevano distrutto York. Ma non riuscì ad arrivare più a nord di Pontefract. Dopo averci provato per diverse settimane Guglielmo corruppe la flotta danese affinché si ritirasse da York per l'inverno. Essi accettarono e tornarono alla foce dell'Humber per svernare lì. Guglielmo fu ora in grado di spostarsi fino a York. Lì ricostruì i castelli. Poi fece sparpagliare le sue forze e distrusse tutto ciò che serviva all'esercito inglese e danese per nutrirsi. Il risultato fu una carestia diffusa e la gente della zona se ne andò o morì di fame. Questa fu la famigerata persecuzione di Guglielmo del Nord. Il risultato di tutto ciò fu la resa dei suoi conti inglesi e della maggior parte dei ribelli in Inghilterra. I pochi gruppi rimasti furono rapidamente schiacciati dall'esercito di Guglielmo. Ma un gruppo si dimostrò più ostinato. Questo era a Chester e dopo una marcia forzata durante l'inverno, Guglielmo li sorprese prima che fossero pronti. Dopo la loro resa costruì lì altri due castelli e poi tornò a Winchester.
Governare l'Inghilterra e la Normandia
Guglielmo non dovette mai più distruggere una contea come fece nello Yorkshire. Aveva affrontato le principali minacce al suo dominio, ma alcune erano state risolte solo in parte. La flotta danese tornò nel 1070, questa volta guidata dal re Swen. Si unirono a un piccolo gruppo di ribelli sull'isola di Ely guidati da Hereward the Wake. Ancora una volta Guglielmo corruppe i danesi affinché se ne andassero e poi si occupò dei ribelli. Di Hereward non si seppe più nulla.
Guglielmo ora doveva governare sia l'Inghilterra che la Normandia. Scoprì che doveva essere presente per tenere le cose sotto controllo. Quando era in Normandia i problemi scoppiavano spesso in Inghilterra. Quando era in Inghilterra, però, la Normandia era governata da sua moglie Matilde. Ma Fulk Rechin, il nuovo conte d'Angiò, aveva sottratto il Maine al controllo di Guglielmo. Guglielmo dovette riprenderlo nel 1073.
Nel 1082 Guglielmo arrestò il suo fratellastro Odo, vescovo di Bayeux e conte di Kent. Le ragioni sono incerte, ma Odo stava cercando di radunare un esercito per marciare su Roma. Il suo piano era quello di diventare il prossimo Papa. Guglielmo lo mise sotto processo sull'Isola di Wight. Oltre ad altri crimini c'era quello di cercare di radunare un esercito tra i soldati di Guglielmo. Come Guglielmo fece notare, erano necessari per la difesa dell'Inghilterra. Odo protestò che nemmeno un re poteva giudicarlo. Come vescovo solo il Papa poteva. Guglielmo rispose che non stava sequestrando un vescovo, stava sequestrando il suo conte che aveva lasciato in carica durante la sua assenza. Odo fu imprigionato in Normandia per il resto della sua vita.
Nel 1083 la regina Matilde morì e fu sepolta a Caen. I due erano stati molto vicini e si erano trovati in disaccordo solo per il loro figlio Robert Curthose. Roberto si era ripetutamente ribellato a suo padre, ma era rimasto in contatto con sua madre. Questo causò una spaccatura tra loro. Filippo I di Francia aveva trovato difficile che il suo vassallo diventasse un re come lui e così si risentì con Guglielmo. Non essendo abbastanza forte per combattere Guglielmo da solo, quando Robert Curthose si ribellò a suo padre, il re Filippo lo aiutò.
Nell'estate del 1085 Guglielmo venne a sapere che Canuto IV di Danimarca stava preparando una flotta per salpare contro l'Inghilterra. Guglielmo tornò in Inghilterra in autunno con molti soldati. Dovette pagarli e nutrirli, a caro prezzo. Potrebbe essere stato in questo momento che si rese conto di non avere alcuna documentazione di ciò che gli era dovuto come re. Non sapeva se stava raccogliendo tutte le tasse che erano dovute.
Il libro di Domesday
Alla sua corte di Natale a Gloucester nel 1085 Guglielmo chiese che fosse fatta una grande indagine in ogni parte dell'Inghilterra. Il re voleva sapere quante persone vivevano nel suo [regno]. Voleva sapere la dimensione di ogni proprietà, quanto valeva ognuna di esse e quanto reddito portava. Nessuna indagine del genere era mai stata fatta prima in Inghilterra. Fu unico per i suoi dettagli e per il suo contributo alla storia inglese. Il Domesday Book fu il primo documento pubblico in Inghilterra.
Il testo del libro si adatta a due volumi. Il primo copriva trentuno contee. Fu chiamato 'Great Domesday' a causa delle sue dimensioni. Il secondo copriva le contee di Essex, Norfolk e Suffolk ed era chiamato "Little Domesday". I fatti furono registrati da diversi pannelli composti da vescovi e conti. Ogni pannello raccoglieva informazioni su diverse contee. Guglielmo ricevette una grande collezione di registrazioni scritte il 1° agosto 1086. Questo divenne il Domesday Book, anche se non sarebbe stato rilegato in libri per quasi un altro secolo.
Ultimi anni
William morì quando si trovava a Rouen, in Francia, per le ferite che aveva ricevuto cadendo da un cavallo di sua proprietà.