Zooxanthellae
Alcuni dinoflagellati sono zooxantelle: endosimbionti di eucarioti marini e animali come i coralli antozoi. Questi coralli che costruiscono la barriera corallina dipendono in gran parte da loro. Altri organismi che possono ospitare zooxantelle sono meduse, vongole, foraminiferi, lumache di mare, cioè nudibranchi, e anche ciliati e radiolarie.
Maree rosse
I dinoflagellati sono responsabili delle "maree rosse" che possono avvelenare i pesci. A volte fioriscono in concentrazioni di più di un milione di cellule per millilitro. Alcune specie producono neurotossine, che in tali quantità uccidono i pesci e si accumulano nei filtratori come i molluschi, che a loro volta possono trasmetterle alle persone che le mangiano. Questo fenomeno è chiamato marea rossa, dal colore che la fioritura conferisce all'acqua. Non tutte le fioriture di dinoflagellate sono pericolose. Gli sfarfallii bluastri visibili nell'acqua dell'oceano di notte provengono spesso da fioriture di dinoflagellati bioluminescenti, che emettono brevi lampi di luce quando vengono disturbati.
Classificazione
Anche se classificati come eucarioti, i nuclei dei dinoflagellati mancano di alcune caratteristiche chiave dei nuclei eucarioti. Infatti, Dodge ha definito il nucleo delle dinoflagellate come mesocariotico, a causa del suo possesso di caratteristiche intermedie tra le aree di DNA arrotolato dei batteri procariotici e il nucleo eucariotico ben definito. Questo gruppo, tuttavia, contiene organelli tipicamente eucarioti, come i complessi di Golgi, i mitocondri e i cloroplasti.
Il gruppo contiene molti organelli e stili di vita complessi. Alcuni hanno strutture simili agli occhi dei vertebrati; alcuni hanno nematocisti; alcuni vivono come plasmodi (forme multinucleate); alcuni hanno due flagelli; i dinoflagellati fotosintetici contengono una "serie sconcertante" di tipi di plastidi; e tutta la loro genetica e biologia cellulare è eccentrica.
Fossili
I dinoflagellati fossili sono importanti per la stratigrafia, la datazione e la correlazione degli strati. Durante la loro vita, i dinoflagellati hanno una forma planctonica mobile e una fase cistica resistente che permette loro di sopravvivere durante l'inverno nei sedimenti. Solo la ciste si fossilizza. La loro prima apparizione certa è nel periodo Siluriano, con una grande radiazione nell'era Mesozoica. p440 Sono classificati come Phylum Dinomastigota da Margulis e colleghi.
