La Florida è uno stato biodiverso, con 3.500 piante vascolari native e 1.500 vertebrati, un numero superiore a tutti gli altri stati tranne tre. Uno studio dell'Organizzazione delle Nazioni Unite per l'alimentazione e l'agricoltura del 2003 ha dichiarato che lo Stretto della Florida ha la più alta biodiversità dell'Oceano Atlantico e ospita 25 specie endemiche.
Flora
La marea rossa è stata un problema anche sulla costa sudoccidentale della Florida. Mentre ci sono state molte congetture sulla causa della fioritura delle alghe tossiche, non ci sono prove che sia stata causata dall'inquinamento o che ci sia stato un aumento della lunghezza o della frequenza dei focolai di marea rossa.
Parassiti floreali
La flora autoctona è minacciata da varie piante invasive, tra cui il pepe brasiliano (Schinus terebinthifolius). Il possesso e la coltivazione di questo albero è illegale. Un gran numero di volontari abbatte questi invasori, in particolare lungo i corsi d'acqua. Il pino australiano (Casuarina spp.) viene attaccato attivamente.
Tra gli altri parassiti stranieri vi è il coleottero asiatico ambrosia (Xyleborus glabratus), che minaccia l'industria locale dell'avocado e gli alberi rossi (Persea borbonia).
È illegale importare lumache giganti africane (achatina fulica). Queste minacciano gli edifici, 500 tipi di piante locali, e portano la meningite.
Fauna
Le specie endemiche in Florida includono il Florida Scrub Jay (Aphelocoma coerulescens), Miami blue (Cyclargus thomasi bethunebakeri), Okaloosa darter (Etheostoma okaloosae), e Key Deer (Odocoileus virginianus clavium).
La Florida è una destinazione popolare per il birdwatching, a causa delle numerose specie che si possono trovare nello stato in vari periodi dell'anno. La Florida Ornitological Society mantiene l'elenco ufficiale dello stato degli uccelli della Florida, che attualmente contiene 498 specie. Uno studio pubblicato nel 2003 dalla Florida Fish and Wildlife Conservation Commission ha documentato 196 specie di uccelli che sono state confermate per riprodursi nello stato, con altre 19 specie elencate come possibili o probabili riproduttori. Il Great Florida Birding Trail, un sentiero lungo 2.000 miglia (3.200 km), è composto da 489 località in tutto lo stato che sono eccellenti siti di osservazione.
La pesca sportiva è popolare anche in Florida; oltre 250 specie diverse di pesci (comprese 73 specie non autoctone) si trovano in Florida. Ci sono più di 1.000 specie di pesci nelle acque costiere della Florida.
Nel 2010, il NOAAA, citando il Magnuson-Stevens Act, ha vietato la pesca del lutiano rosso fino a quando la popolazione non avrà il tempo di riprendersi.
La costa atlantica della Florida ospita l'unica barriera corallina estesa degli Stati Uniti continentali e la terza più grande al mondo. L'intero sistema di barriera corallina delle Florida Keys fa parte del Florida Keys National Marine Sanctuary, e gran parte della barriera corallina è protetta come parte del Biscayne National Park.
Nel 1977 il governo federale ha inserito gli alligatori nell'elenco delle specie in via di estinzione. Sono stati rimossi dalla lista delle specie in via di estinzione nel 1987 e la Florida ha permesso la caccia selettiva nel 1988.
Habitat di uccelli e tartarughe
Nel 1987, Brevard County, Florida, ha ospitato l'ultimo membro del Dusky Seaside Sparrow, ormai estinto. Ci sono state solo due specie di uccelli estinti da quando l'elenco delle specie in via di estinzione è iniziato nel 1973. Questo evento ha rappresentato una sfida per garantire che altre preoccupazioni ambientali vengano affrontate rapidamente.
Si pensa che il Florida Scrub Jay sia minacciato da molti anni, perché la specie è territoriale e non può spostarsi su terreni migliori quando il suo habitat è in pericolo.
Le spiagge di nidificazione delle tartarughe marine sono protette.
