Cinque strati compongono l'atmosfera del Sole. La cromosfera, la regione di transizione e la corona sono molto più calde della superficie esterna della fotosfera del Sole. Si ritiene che le onde Alfvén possano passare per riscaldare la corona.
La zona di minima temperatura, lo strato più freddo del Sole, è circa 500 chilometri sopra la fotosfera. Ha una temperatura di circa 4.100 K (3.830 °C; 6.920 °F). Questa parte del Sole è abbastanza fredda da permettere la formazione di molecole semplici come il monossido di carbonio e l'acqua. Queste molecole possono essere viste sul Sole con strumenti speciali chiamati spettroscopi.
La cromosfera è il primo strato del Sole che può essere visto, specialmente durante un'eclissi solare quando la luna copre la maggior parte del Sole e blocca la luce più brillante.
La regione di transizione solare è la parte dell'atmosfera del Sole, tra la cromosfera e la parte esterna chiamata corona. Può essere vista dallo spazio usando telescopi che possono percepire la luce ultravioletta. La transizione è tra due strati molto diversi. Nella parte inferiore tocca la fotosfera e la gravità ne modella le caratteristiche. Nella parte superiore, lo strato di transizione tocca la corona.
La corona è l'atmosfera esterna del Sole ed è molto più grande del resto del Sole. La corona si espande continuamente nello spazio formando il vento solare, che riempie tutto il sistema solare. La temperatura media della corona e del vento solare è di circa 1.000.000-2.000.000 K (1.800.000-3.600.000 °F). Nelle regioni più calde è di 8.000.000-20.000.000 K (14.400.000-36.000.000 °F). Non capiamo perché la corona sia così calda. Può essere vista durante un'eclissi solare o con uno strumento chiamato coronografo.
L'eliosfera è la sottile atmosfera esterna del Sole, piena di plasma del vento solare. Si estende oltre l'orbita di Plutone fino all'eliopausa, dove forma un confine dove si scontra con il mezzo interstellare.